پولى پېپتىد پېپتىد زەنجىرىنى لايىھىلەش لايىھىسى ۋە ھەل قىلىش چارىسى

I. خۇلاسە
پېپتىدلار ئالاھىدە ماكرو مولېكۇلا بولۇپ ، ئۇلارنىڭ خىمىيىلىك ۋە فىزىكىلىق ئالاھىدىلىكلىرى تەرتىپسىز.بەزى پېپتىدلارنى بىرىكتۈرۈش تەس ، بەزىلىرىنى بىرىكتۈرۈش بىر قەدەر ئاسان ، ئەمما تازىلاش تەس.ئەمەلىي مەسىلە شۇكى ، كۆپىنچە پېپتىدلار سۇ ئېرىتمىسىدە ئازراق ئېرىيدۇ ، شۇڭا بىزنىڭ ساپلاشتۇرۇشىمىزدا ، گىدروپوپتىك پېپتىدنىڭ ماس قىسمى چوقۇم سۇسىز ئېرىتكۈچىدە ئېرىپ كېتىشى كېرەك ، شۇڭلاشقا ، بۇ ئېرىتكۈچىلەر ياكى بۇففېرلارنىڭ ئىشلىتىلىشى بىلەن بىردەك بولماسلىقى مۇمكىن. بىئولوگىيىلىك تەجرىبە تەرتىپلىرىنىڭ ، تېخنىكلارنىڭ پېپتىدنى ئۆز مەقسىتىدە ئىشلىتىشى قەتئىي مەنئى قىلىنىدۇ ، شۇڭا تۆۋەندىكى تەتقىقاتچىلار ئۈچۈن پېپتىد لايىھىلەشنىڭ بىر قانچە تەرىپى.

پولى پېپتىد پېپتىد زەنجىرىنى لايىھىلەش لايىھىسى ۋە ھەل قىلىش چارىسى
ئىككىنچىدىن ، بىرىكمە قىيىن پېپتىدلارنى توغرا تاللاش
1. تۆۋەنگە تەڭشەلگەن تەرتىپلەرنىڭ ئومۇمىي ئۇزۇنلۇقى
پېپتىدنىڭ 15 ھەسسىسىگە يەتمەيدىغان پېپتىدلارغا ئېرىشىش ئاسان ، چۈنكى پېپتىدنىڭ چوڭ-كىچىكلىكى ئېشىپ ، خام مەھسۇلاتنىڭ ساپلىقى تۆۋەنلەيدۇ.پېپتىد زەنجىرىنىڭ ئومۇمىي ئۇزۇنلۇقى 20 قالدۇقتىن ئېشىپ كەتكەچكە ، مەھسۇلاتنىڭ ئېنىق مىقدارى مۇھىم مەسىلە.نۇرغۇن سىناقلاردا قالدۇق ساننى 20 دىن تۆۋەنلىتىش ئارقىلىق ئويلىمىغان ئۈنۈمگە ئېرىشىش ئاسان.
2. گىدروپوبىك قالدۇقلىرىنىڭ سانىنى ئازايتىش
گىدروپوبىك قالدۇقلىرى كۆپ بولغان پېپتىدلار ، بولۇپمۇ رايوندا C تېرمىنالىنىڭ 7-12 قالدۇقلىرى ئادەتتە بىرىكمە قىيىنچىلىقلارنى كەلتۈرۈپ چىقىرىدۇ.بۇ بىرىكتۈرۈشتە B قاتلىنىدىغان جەدۋەلگە ئېرىشكەنلىكى ئۈچۈن ، بۇ يېتەرلىك بولمىغان بىرىكمە دەپ قارىلىدۇ.«بۇنداق ئەھۋال ئاستىدا ، ئىككىدىن ئارتۇق ئاكتىپ ۋە مەنپىي قالدۇقنى ئۆزگەرتىش ياكى Gly ياكى Pro نى پېپتىدقا سېلىپ پېپتىد تەركىبىنى ئېچىش پايدىلىق بولۇشى مۇمكىن».
3. «قىيىن» قالدۇقلارنى تەڭشەش
«Cys ، Met ، Arg ۋە سىناپ بېقىش قالدۇقلىرى بار ، ئادەتتە ئاسان بىرىكتۈرۈلمەيدۇ».Ser ئادەتتە Cys نىڭ زەھەرسىزلاندۇرۇش ئۇسۇلى سۈپىتىدە ئىشلىتىلىدۇ.
پولى پېپتىد پېپتىد زەنجىرىنى لايىھىلەش لايىھىسى ۋە ھەل قىلىش چارىسى

ئۈچىنچىسى ، سۇدا ئېرىيدىغان توغرا تاللاشنى ياخشىلاش
1. N ياكى C تېرمىنالىنى تەڭشەڭ
كىسلاتالىق پېپتىدلارغا سېلىشتۇرغاندا (يەنى pH 7 دە مەنپىي زەرەتلىنىدۇ) ، ئاتسېتىلسىيە (N- تېرمىنۇس ئاتسېتىلسىيەسى ، C تېرمىنالى ھەمىشە ھەقسىز كاربون گۇرۇپپىسىنى ساقلاپ قالىدۇ) پاسسىپ توكنى ئاشۇرۇش تەۋسىيە قىلىنىدۇ.قانداقلا بولمىسۇن ، ئاساسلىق پېپتىدلار ئۈچۈن (يەنى pH 7 دە مۇسبەت زەرەتلىنىدۇ) ، ئامىنو (N تېرمىنالىدىكى ھەقسىز ئامىنو گۇرۇپپىسى ۋە C تېرمىنالىدا ئامىنو) ئاكتىپ زەرەتنى ئاشۇرۇش تەۋسىيە قىلىنىدۇ.

2. تەرتىپنى زور دەرىجىدە قىسقارتىڭ ياكى ئۇزارتىڭ

بەزى تەرتىپلەردە كۆپ مىقداردا گىدروپوبىكلىق ئامىنو كىسلاتاسى بار ، مەسىلەن Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr ۋە Ala قاتارلىقلار. بۇ گىدروپوبىك قالدۇقلىرى% 50 تىن ئېشىپ كەتسە ، ئادەتتە ئېرىپ كېتىش ئاسان ئەمەس.پېپتىدنىڭ مۇسبەت ۋە مەنپىي قۇتۇبىنى تېخىمۇ ئاشۇرۇش ئۈچۈن تەرتىپنى ئۇزارتىش پايدىلىق بولۇشى مۇمكىن.ئىككىنچى تاللاش ، پېپتىد زەنجىرىنىڭ چوڭ-كىچىكلىكىنى تەڭشەپ ، گىدروپوبىك قالدۇقلىرىنى تەڭشەش ئارقىلىق مۇسبەت ۋە مەنپىي قۇتۇپلارنى ئاشۇرۇش.پېپتىد زەنجىرىنىڭ مۇسبەت ۋە سەلبىي تەرەپلىرى قانچە كۈچلۈك بولسا ، سۇ بىلەن ئىنكاس قايتۇرۇش ئېھتىماللىقى شۇنچە يۇقىرى بولىدۇ.
3. سۇدا ئېرىيدىغان قالدۇقنى قويۇڭ
بەزى پېپتىد زەنجىرىگە نىسبەتەن ، بەزى ئاكتىپ ۋە مەنپىي ئامىنو كىسلاتالىرىنىڭ بىرىكىشى سۇنىڭ ئېرىشچانلىقىنى يۇقىرى كۆتۈرەلەيدۇ.شىركىتىمىز كىسلاتالىق پېپتىدلارنىڭ N تېرمىنالى ياكى C تېرمىنالىنىڭ Glu-Glu بىلەن بىرىكىشىنى تەۋسىيە قىلىدۇ.ئاساسىي پېپتىدنىڭ N ياكى C تېرمىنالى بېرىلدى ، ئاندىن Lys-Lys.ئەگەر زەرەتلەنگەن گۇرۇپپىنى ئورۇنلاشتۇرغىلى بولمىسا ، Ser-Gly-Ser نى N ياكى C تېرمىنالىغىمۇ قويغىلى بولىدۇ.قانداقلا بولمىسۇن ، پېپتىد زەنجىرىنىڭ يان تەرىپىنى ئۆزگەرتكىلى بولمىغاندا ، بۇ ئۇسۇل كارغا كەلمەيدۇ.